Schloss Schackenborg ist heute Eigentum der Schackenborg-Stiftung und wird von ihr betrieben. Die Stiftung wurde am 30. Juni 2014 von Prinz Joachim, Bitten und Mads Clausens Fond, ECCO Holding A/S und Ole Kirks Fond gegründet und hat Prinz Joachim und Prinzessin Marie als Schirmherren. Die Stiftung ist eine gemeinnützige, kommerzielle Stiftung, die das Schloss Schackenborg und einen dazugehörigen Bauernhof mit dem Ziel übernommen hat, das Schloss und den Park für die Öffentlichkeit zu öffnen, um der königlichen Familie Gelegenheit zu gelegentlichen Aufenthalten auf dem Schloss zu geben den engen Kontakt zwischen dem Königshaus und Sonderjütland aufrechtzuerhalten und, soweit möglich, gemeinnützige und gemeinnützige Zwecke zu unterstützen.
Der Stiftungszweck ist somit:
- Besitz, Betrieb und Erhalt von Schloss und Park Schackenborg sowie der zugehörigen historischen Inhalte des Schlosses.
- Bereitstellung öffentlicher Zugänglichkeit zum Schloss und Park.
- Um Ihren Königlichen Hoheiten Prinz Joachim und Prinzessin Marie, den Nachkommen von Prinz Joachim und anderen Mitgliedern der dänischen Königsfamilie Gelegenheit zu gelegentlichen Aufenthalten in Schackenborg zu geben.
- Förderung gemeinnütziger und gemeinnütziger Zwecke, insbesondere kultureller, wissenschaftlicher, sozialer und pädagogischer Zwecke, soweit dies nach Einschätzung des Vorstandes finanziell möglich ist.